شورای پژوهش، متشکل از مدیر مدرسه، معاونین محترم آموزش و پژوهش، یکی از طلاب و همچنین یکی از اساتید می باشد. در این شورا جهت برنامههای پژوهشی سیاستگذاری و برنامهریزی میشود.
برای پایهی دوم، هفتهای یک جلسه دوره ی مهارتها و پیشنیازهای پژوهشی از قبیل: خلاصهنویسی، منبعشناسی، فیشبرداری، بندچینی، شیوه نگارش علمی و… برگزار میشود. از طلاب پایهی دوم خواسته میشود با توجه به استانداردهای آموزش دیده شده، نوشتاری را تنظیم کنند و معاون محترم پژوهش به ارزیابی آنها میپردازد. پس از تکمیل، در خبرنامهی داخلی از آنها استفاده میشود.
برای پایههای سوم و بالاتر، در ترم اول هفتهای یک جلسه دورهی روش مقالهنویسی، در سطوح مقدماتی برای پایه سوم، متوسطه برای پایه چهارم و پیشرفته برای پایه پنجم برگزار میشود. در ترم دوم نیز با راهنمائی استاد مربوطه و معاون محترم پژوهش، اقدام به نوشتن مقاله میکنند و در پایان سال، مقالات تحویل گرفته میشود و در صورت تایید، جهت چاپ در نشریههای علمی، راهنمائی میشوند.
در هر ترم، نشست های علمی در دو قالب، با برنامهریزی قبلی انجام میشود. در این جلسات تمامی طلاب و اساتید و کادر شرکت مینمایند.
قالب اول عبارت است از تحلیل مقالات علمی. در این قالب یک مقالهی مناسب توسط معاون محترم پژوهش انتخاب میشود. سپس ساختار و محتوای آن توسط طلاب تحلیل میشود. معاون محترم پژوهش به عنوان ناظر نشست به طلاب محترم کمک میکند.
قالب دوم عبارت است از ارائه و نقد علمی آراء و نظرات خاص، پیرامون موضوعات پرکاربرد در فضای جامعه، این نشست نیز با حضور تمامی طلاب و اساتید محترم برگزار میشود. در این نشست از اساتید محترم، جهت ارائه و نقد علمی آراء و نظرات موجود پیرامون موضوعات مشخص شده استفاده میشود. معاون محترم پژوهش به عنوان دبیر جلسه، نشست مذکور را اداره خواهد کرد.
معاون محترم پژوهش، فراخوانهای آثار پژوهشی را از مراکز مختلف دنبال میکند. چنانچه موضوعاتی قابل تحقیق و متناسب با سطح علمی طلاب باشد، از طلاب خواسته میشود تا در صورت تمایل در آن موضوع تحقیق کنند و جهت نوشتن مقاله، به آنان مشاوره داده میشود.
طلاب محترم پایه سوم و بالاتر، لازم است جهت تکمیل نمرهی درسی خود، در برخی مواد درسی پژوهش ارائه دهند. معاون محترم پژوهش، جهت انتخاب موضوع و انجام مراحل مختلف تحقیق، به طلاب محترم مشاوره میدهد.
سالانه طلابی که به تحقیق و پژوهش میپردازند، استعداد سنجی میشوند. طلاب محترمی که توان نگارش مقالهی علمی را دارند، جهت شرکت در جشنوارهی علامه حلیره تشویق میشوند و در انجام مراحل پژوهش، به آنها مشاوره داده میشود.